Lek należy przyjmować godzinę przed posiłkiem, połykać w całości popijając wodą.
Dorośli i młodzież po 12. roku życia:
Refluksowe zapalenie przełyku: zwykle 40 mg 1 raz na dobę, w niektórych sytuacjach lekarz może zalecić 80 mg na dobę. Leczenie trwa zwykle 4-8 tygodni.
Dorośli:
Eradykacja H. pylori 40 mg 2 razy na dobę w skojarzeniu z zaleconymi antybiotykami w zależności od przyjętego schematu leczenia. Drugą tabletkę preparatu należy przyjąć 1 godzinę przed kolacją. Leczenie trwa 7 dni, w razie potrzeby do 14 dni. Następnie lekarz może zalecić przyjmowanie pantoprazolu w celu całkowitego wyleczenia choroby wrzodowej zalecając dawkowanie jak w leczeniu choroby wrzodowej żołądka i dwunastnicy.
Choroba wrzodowa żołądka: 40 mg na dobę, w razie potrzeby 80 mg na dobę. Leczenie trwa zwykle 4–8 tygodni.
Choroba wrzodowa dwunastnicy: 40 mg na dobę, w razie potrzeby 80 mg na dobę. Leczenie trwa zwykle 2–4 tygodni.
Zespół Zollingera i Ellisona oraz inne stany chorobowe związane z nadmiernym wydzielaniem kwasu solnego: początkowo 80 mg 1 raz na dobę, następnie dawkę ustala się indywidualnie na podstawie wyników badań wydzielania kwasu żołądkowego, w razie konieczności możliwe jest krótkotrwałe zwiększenie dawki do ponad 160 mg na dobę. Jeżeli dawki są większe niż 80 mg na dobę powinny być przyjmowane w 2 dawkach podzielonych. Czas trwania leczenia określi lekarz.
Ze względu na brak wystarczających danych klinicznych nie zaleca się stosowania preparatu u dzieci do 12. roku życia.
U osób z ciężką niewydolnością wątroby nie należy stosować dawki większej niż 20 mg na dobę. Nie należy stosować preparatu w celu eradykacji H. pylori u chorych z zaburzeniami czynności nerek lub umiarkowanymi albo ciężkimi zaburzeniami czynności wątroby. Nie ma potrzeby modyfikacji dawkowania u osób w podeszłym wieku ani u osób z zaburzeniami czynności nerek.